如果怀孕6个月发现胎儿畸形，如何处理需要根据具体的情况决定。

　　如果想要继续妊娠的愿望强烈，且孩子的畸形程度并不严重，比如唇腭裂、多指等，出生后并不会对存活率造成明显的影响，此时是可以继续维持妊娠的。但是需要注意定期去医院产检，密切观察胎儿的发育情况。

　　如果孩子的畸形比较严重，比如严重的先天性心脏病、脊柱裂、大脑发育畸形等，此时无论孕妇继续妊娠的愿望是否强烈，都应该及时终止妊娠，因为此类畸形胎儿出生后存活的几率比较低。即使能够存活，也无法像正常孩子的一样生长发育，还会给家庭带来较重的负担。