氟尿嘧啶副作用有胃肠道反应，如食欲减退、恶心、呕吐、腹部不适或者腹泻等等，还可能有骨髓抑制，如白细胞减少，多在用药后10到14天左右达到最低点。

　　血小板减少比较少见，还可能有口腔黏膜或者口腔溃疡、咽炎、脱发、静脉炎、指甲皮肤色素沉着，小脑供给失调等情况。

　　静滴时药物外渗可引起局部疼痛坏死或者蜂窝组织炎，长期应用可以导致神经系统毒性，偶有用药后心肌缺血，可出现心绞痛和心电图变化，所以要在临床医生的指导下使用本药，一旦有不适，要及时的告知医生进行调整。