胃肠道间质瘤不是癌症。胃肠道间质瘤和胃肠道癌症是两种不同的疾病，和癌症不同，胃肠道间质瘤一般是起源于间质细胞，或其前体细胞，而癌症一般起源于胃肠道上皮细胞。

　　其次，典型的胃肠道间质瘤一般位于消化道黏膜基层或者固有肌层，而胃肠道的癌症一般起源于上皮，位于胃肠道的黏膜层。

　　另外，胃肠道间质瘤仅仅是一种存在恶性潜能，存在一定转移率的肿瘤，而胃肠癌症是一种恶性肿瘤。