根据肿瘤大小、位置、分裂相、瘤体是否破裂，可以将胃肠道间质瘤分为极低危、低危、中危和高危四组，一般来讲，极低危、低危胃肠道间质瘤是可以治愈的，而中危和高危胃肠道间质瘤在进行手术治疗之后，还需要联合运用靶向药物来治疗，随着一些靶向药物的开发，中危和高危胃肠道间质瘤的患者，有望实现长期缓解。