感染性疾病可以根据不同病原体分类有病毒感染性疾病、细菌感染性疾病、支原体感染性疾病和衣原体感染性疾病等。
根据传播途径不同可以分为消化道感染性疾病、呼吸道感染性疾病、生殖器官感染性疾病和血液系统感染性疾病等。根据病毒类型的分型可以分为甲肝、乙肝、丙肝、艾滋病和尖锐湿疣等。