阴茎上长小水泡，考虑是阴茎疱疹或者阴茎感染所引起。当阴茎发生细菌感染时候，这些细菌就会刺激阴茎，导致阴茎头红肿或者出现小水泡。此时，患者还会并发疼痛症状，需要给予含有抗生素药膏进行局部消炎治疗。

　　另外，阴茎发生疱疹病毒感染时，也会导致阴茎出现小水泡，患者还会感觉伴有阴茎疼痛。此时，就需要给予抗病毒治疗。