患者脸上长了一个扁平疣主要是由人乳头瘤病毒感染皮肤所导致，治疗方法可以通过药物治疗、手术治疗以及物理治疗等，具体情况如下：

　　1、药物治疗

　　患者可以遵医嘱选用抗病毒的药物，比如咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等，还可以使用水杨酸药物，能够促进表皮剥脱，对于免疫力低下者可以服用免疫调节制剂，比如胸腺肽、白介素等。

　　2、手术治疗

　　患者可以采用自体疣免疫疗法，将自体疣植入皮下脂肪层，能够使体内产生抗病毒抗体，从而清除表皮上的人乳头瘤病毒。

　　3、物理治疗

　　对于扁平疣数目较少者，可以采取冷冻、电灼、激光等方法治疗，可以将疣体去除。