怀孕两个月时出现胚胎停育的原因如下：

　　一、可能与受精卵质量差、遗传免疫因素有关。

　　二、可能与卵巢分泌的雌激素和孕激素水平低下有关。

　　三、如果受到细菌感染、病毒感染也会导致胚胎停育。

　　四、如果存在宫腔畸形、子宫肌瘤等情况，也会造成胚胎停育。

　　发生胚胎停育的时候，最好及时化验胚胎组织，然后寻找原因。