无创DNA检查是通过母体外周血液中的胎儿游离DNA进行检测，羊水穿刺是直接收集羊水中的胎儿脱落细胞进行检测。无创DNA是一种筛查，不能作为确诊诊断，而羊水穿刺的结果可以作为确诊依据。

　　无创DNA受到很多因素的限制，例如输血、免疫性疾病、恶性肿瘤等，而羊水穿刺不受限制。无创是一种无创检查，而羊水穿刺有一定的感染和流产风险。