婴儿乳糖不耐受的原因有两种，一种是先天因素，一种是继发因素。

　　先天乳糖不耐受属于孩子自身体质的问题，自身中间缺乏乳糖酶或乳糖酶的活性不足，所以导致食用乳制品后出现腹痛、腹泻、腹胀等消化道症状，此情况没有办法自愈。

　　乳糖不耐受本身会伴随孩子终生，但此矛盾在早期较为突出，即在孩子吃奶时表现突出，随着孩子年龄的增长，奶制品在其饮食结构中所占的比例越来越小，则矛盾得到缓解。因此，只需要在早期使用去乳糖或者低乳糖奶粉喂养，等孩子参加辅食后，奶粉所占的比例越来越小，则乳糖不耐受现象可好转。

　　如果是继发性原因引起，考虑是急性胃肠炎引起胃肠功能紊乱，而引起继发性乳糖不耐受，需待孩子原发病去除后，乳糖不耐受现象能够得到缓解。