血中的胆红素在肝脏内经过一系列处理，通过胆道系统随着胆汁一起进入肠道，然后随粪便一起排出体外。在此过程中会有一小部分进入肠道的胆红素被肠道重新吸收入血，按照原来的途径再次回到肠道，最终排出体外。

　　而胎儿在母体内是相对低氧的环境，因此胎儿的红细胞数量比成人多，因此新生儿出生后所携带的红细胞也比成人高，同时此时期的红细胞寿命很短，而新生儿脱离母体后会建立自己的呼吸。因此在出生后，新生儿体内的红细胞在比较短的时期内会被大量破坏，而新生儿自身的肝脏功能发育还不成熟，还没有能力处理掉胆红素，因此短时间内会有大量的胆红素在体内蓄积，以上就是新生儿生理性黄疸的来源。