多系统萎缩的患者由于肌肉的萎缩和肌肉力量的下降，因此患者容易产生跌倒和各种外伤。另外，如果患者出现了长期的卧床，还可以产生压疮和深静脉血栓等。随着病情的发展，多系统萎缩的患者可以出现吞咽困难以及呼吸困难，比如患者会出现饮水呛咳以及误吸、窒息等。

　　部分多系统萎缩的患者到了晚期，还容易产生肝肾功能的损害以及多脏器功能衰竭等非常严重的情况。