外用的他克莫司主要应用在皮肤病中，其属于钙调神经磷酸酶抑制剂，具有明显的抗炎作用，同时有促进胶原合成、对抗炎症反应、协同恢复皮肤屏障的作用，其还能抑制嗜酸性粒细胞的功能，所以有抗过敏的作用。其对皮肤末梢神经也有影响，所以能使瘙痒受体去敏化后，瘙痒的症状减轻，达到抗瘙痒的作用。

　　他克莫司还有明确的抗微生物作用，所以其有抑制细菌、真菌的功能。通过其药理机制知道他克莫司在外用于皮炎、湿疹类的皮肤病上能够起效快的原因。