更年期月经后有褐色分泌物可能是正常现象，也有可能是患有细菌性阴道炎或宫颈炎等疾病引起的。

1、正常现象：更年期的时候体内激素水平会异常，有可能会引起月经紊乱，比如经期延长，会有褐色分泌物，属于正常现象。需要注意保持阴部清洁卫生，预防感染。

2、细菌性阴道炎：由于细菌感染引起，可能会导致阴道异常出血，所以会有褐色分泌物。需要遵医嘱服用阿莫西林胶囊、头孢克肟片等药物治疗，能够促使炎症消除。

3、宫颈炎：一般是由于病原体感染引起的，会引起分泌物增多，分泌物可能会呈褐色。需要配合医生服用甲硝唑片、替硝唑片等药物治疗，能够促进恢复。

除此以外，还有可能是卵巢功能早衰等因素所致，需要到医院检查诊断。