肛周脓肿一旦形成，最佳治疗方法就是到医院急诊行肛周脓肿切开引流，术后对脓肿腔进行反复冲洗，留有油纱条，反复进行定期更换切口敷料，这样使肛周脓肿的脓腔迅速引流之后，基底部能够快速的愈合。

　　同时也要对脓性的渗出物做药敏实验和菌培养，找到敏感的药物口服或者是静脉注射，这样肛周脓肿会更加快速的愈合。