牙齿有囊肿，应该是指牙周组织的囊肿，其治疗并不一定是切掉治疗，要根据囊肿的位置、范围、大小、感染情况来判断具体的治疗方案。常见的囊肿如根尖周囊肿、颌骨囊肿、含牙囊肿等。

1、根尖周囊肿：如果是牙源性疾病导致的根尖周炎，引起根尖囊肿，囊肿范围较小，骨质破坏程度较轻，尚未造成严重的感染，不影响邻近组织，可以先通过保守治疗，控制根尖感染，进行根管治疗，尽量保留牙体组织，然后再恢复牙齿形态，则不需要切除。

2、颌骨囊肿、含牙囊肿：必须通过手术治疗，完整的摘除囊肿，因其囊肿的位置会影响周围的组织，范围波及较广，囊肿过大时会影响美观或其他功能，甚至囊肿反复引起感染，全身症状明显。这种情况的患者应该到口腔正规医院，拍摄口腔CBCT，确定囊肿的位置，只有切除囊肿，刮除囊壁才能够有效的缓解其破坏骨头的程度，避免由于囊肿的存在导致邻牙根尖的吸收，所以应该尽早到口腔颌面外科进行囊肿切除术。