吃了不干净的东西肚子疼，可能是急性胃肠炎、食物中毒等原因引起的，应该根据不同病因采取不同的治疗措施。

1、急性胃肠炎：通常由于进食不洁、生冷或者刺激性食物引起的，病因包括细菌、病毒等感染，可以表现为腹痛、恶心、呕吐、腹泻等症状，严重者还可出现发热、电解质紊乱、脱水等情况，可完善血常规、大便常规及粪便培养等检查，明确感染源后使用诺氟沙星、环丙沙星等喹诺酮类抗生素抗感染治疗，伴有腹泻可借助蒙脱石散、复方地芬诺酯片、洛哌丁胺等药物止泻处理，同时积极补液。

2、食物中毒：吃了一些被细菌或细菌霉素所污染的食物引起的，表现为腹痛、恶心、呕吐、腹泻等症状，临床可使用溴丙胺太林片、阿托品、山莨菪碱等药物止吐止痛，同时积极补液处理，存在沙门菌、副溶血弧菌可选用左氧氟沙星、环丙沙星等抗生素抗感染处理。

吃不干净的东西肚子疼，建议及时医院就诊，明确诊断后在医生指导下服用药物。