肛门有米粒大小肉疙瘩考虑可能是痔疮、直肠脱垂、肛乳头肥大、尖锐湿疣等疾病，需要根据不同的原因做不同的治疗。具体如下：

1、痔疮：痔疮主要是由于直肠静脉的曲张所导致，长期饮酒、饮食和作息不规律以及怀孕等因素可导致直肠静脉丛充血，诱发痔疮的形成。痔疮主要包括内痔，外痔和混合痔，其中内痔主要的临床表现是出血和脱出，可表现为在咳嗽或者排便时有痔核脱出，严重时不能还纳，表现为在肛门口有疙瘩样的肿物脱出，大小可呈米粒样，还可有大便带血等症状。对于一般性治疗无效的痔疮患者，需要药物治疗来促进其恢复，包括外用痔疮膏或痔疮栓、高锰酸钾温水坐浴、中药熏蒸等。对于保守治疗均无效或者症状持续加重的情况，需要行物理治疗，如注射硬化剂治疗（如消痔灵注射液、4%明矾水溶液等）、激光切除治疗等，必要时还可行手术治疗，术式包括单纯痔核切除术、外剥内扎术、吻合器痔上黏膜环切术等。日常需增加富含粗纤维的食物，改变不良的大便习惯，保持大便通畅，防治便秘和腹泻。

2、直肠脱垂：直肠壁部分或全层向下移位，称为直肠脱垂，主要与解剖因素和腹压增大等因素有关。主要症状是直肠黏膜自肛门脱出，表现为肛门外有赘肉，无明显感觉，初发时较小，呈米粒大小肉疙瘩，排便时脱出，以后肿物逐渐增大，最后在咳嗽、用力甚至站立时可脱出，伴有排便不尽和下坠感。治疗上可将5%苯酚植物油注射至脱垂部位的黏膜下层内，使黏膜与肌层产生无菌性炎症，粘连固定；对于完全性直肠脱垂，可行直肠悬吊固定术、PPH术和经会阴直肠切除术等。

3、肛乳头肥大：是一种肛门常见的良性肿瘤，是正常肛乳头因慢性炎症刺激所致纤维结缔组织增生。随着肛乳头逐渐增大，有时可随排便脱出肛外，表现为肛门口有个疙瘩样肿物脱出，大小可呈米粒样，若反复脱出，刺激肛管，可使局部分泌物增多，有时还会出现便后带血，排便不净的感觉和肛门瘙痒。治疗上，首先需要注意调节饮食，忌辛辣刺激性的食物，多吃新鲜的蔬菜水果，保持大便通畅，每日温水坐浴减轻局部炎症反应，病情严重的可采取肛乳头肥大切除术；如果局部有脓肿形成，可在医生指导下口服盐酸左氧氟沙星、头孢氨苄、头孢拉定等抗生素，并且同时进行脓肿切开引流术。

4、尖锐湿疣：是由人乳头状瘤病毒引起的性传播性疾病，典型体征是初起为微小散在的乳头状疣，类似于米粒大小肉疙瘩，柔软，其上有细小的指样突起，或为小而尖的丘疹，质稍硬，孤立、散在或呈簇状，粉色或白色。病灶逐渐增大、增多，互相融合成鸡冠状或菜花状，顶端可有角化或感染溃烂。可以通过电灼、冷冻等物理方法治疗，对于大的疣体需要手术切除。