肛门囊肿并不是痔疮，肛门囊肿即肛门周围软组织囊性肿物，与痔疮是完全不同的两种疾病，肛门囊肿和痔疮在定义、病因、症状与治疗等诸多方面均有所不同，具体如下：

1、定义区别：痔疮是直肠末端粘膜下和肛管皮肤下静脉丛扩张屈曲形成的静脉团，当发病部位位于肛管齿状线以下时称之为外痔，而肛门囊肿一般指的是肛周表皮囊肿，是指肛门周围出现囊性肿块，大多为囊性占位性病变，病灶较浅，属于良性病变。

2、病因区别：痔疮主要是由于不良排便习惯、不良饮食习惯；久坐、长期负重，长期便秘或腹泻、妊娠与分娩等导致腹压长期增高；肝硬化致肛门静脉压力增高；肛周感染致静脉壁受损出现扩大曲张等因素所致，其发病机制主要有肛垫下移学说及静脉曲张学说。肛门囊肿的病因则可能与皮脂腺堵塞、皮下组织感染、先天性发育异常等原因有关。

3、症状区别：痔疮按病变部位可细分为外痔、内痔和混合痔等。外痔以排便时疼痛症状为主，内痔以排便时出血为主要症状，混合痔兼有以上两种症状。而重症痔疮还可能出现肛门坠胀感、排便费时费力、排便频次增多、直肠排空不尽等症状。而肛门囊肿起病初期可无任何症状，随着囊肿体积变大可在肛门表面皮肤出现触感不软不硬或稍软，可移动、有波动感的隆起圆形结节，可压迫肛门括约肌产生直肠坠胀感，肛门表皮囊肿还可继发感染、钙化等，当感染时囊肿迅速肿大，按之可感觉到波动感，囊肿皮肤红肿、发热，由于压迫周围组织可出现剧烈疼痛、压痛等。

4、治疗区别：痔疮以保守治疗为主，可通过调整排便习惯和饮食结构，坐浴、外用药物（如痔疮膏、红霉素软膏、莫匹罗星软膏）等进行保守治疗，必要时可行激光治疗、注射治疗、手术治疗（如单纯痔核切除术、外痔结扎术、PPH等）。如果较小的囊肿未出现症状时无需治疗；如果囊肿较大或者感染时，可选择手术+抗生素的方法，可选择肛门表面囊肿切开引流术、肛门囊肿穿刺引流术、肛门囊肿切除术等，药物的选择如左氧氟沙星、头孢西酮钠等。