表皮囊肿和脂肪瘤的区分，需要在专科医生的体检以及辅助检查下才可以进行有效的区分。

一般脂肪瘤质地较软，表面光滑，活动度较好；而皮脂腺囊肿，其质地一般稍韧，表面是光滑性的，但其移动度相对稍弱。另外，可通过局部的彩超或者CT，以及穿刺病理学的检查，辅助诊断脂肪瘤或皮脂腺囊肿。脂肪瘤和皮脂腺囊肿如其体积较小时，脂肪瘤一般定期复查即可，而皮脂腺囊肿为了预防其发生继发性的感染，可考虑早期即进行手术治疗。