儿童肾病综合征较为严重的，临床治愈率相对较低。长期治疗可降低机体的免疫力，影响身体的发育。病情持续发展会导致感染、血栓形成、肾衰竭等严重疾病的发生，甚至还会危及到生命。

肾病综合征主要损伤肾小球基底膜，导致尿中出现大量蛋白尿，会出现低白蛋白血症。机体会出现水肿，还会引起高胆固醇血症。有的还会出现血压升高，会使肾脏功能受损，体内的有害物质无法排出，最后引起肾功能衰竭，甚至尿毒症。小儿肾病综合征还会出现精神萎靡、乏力、食欲不振，并伴有身体的感染。