很困但是脑袋很清醒在医学上称为睡眠障碍，表现为入睡困难，病因主要分为生理性原因和病理性原因，具体如下：

1、生理性原因：当患者近期生活压力或工作压力大，或者各种事件导致情绪焦虑、紧张、恐惧等状态，导致大脑皮层兴奋性增高，而造成入睡困难。若大脑皮层长期在特定时间段内持续兴奋，可能难以自行抑制，导致睡眠障碍，影响身体健康。

2、病理性原因：主要包括神经衰弱、心理障碍以及其他疾病。如果长期处于紧张状态，如脑力工作者，可出现神经衰弱，患者常表现为易兴奋、易疲劳以及睡眠障碍，但检查并无器质性病变。心理障碍主要是焦虑和抑郁障碍的患者，多伴有睡眠障碍，而表现为入睡困难，还可伴有多梦、易醒。其他疾病是指如果患者有疼痛性疾病、心脑血管或脑部疾病，例如心功能不全、脑血管病、肿瘤等，可能会影响到睡眠质量，导致睡眠节律周期紊乱。