门静脉血栓有很多种病因，常见于：

第一、各种疾病引起的肝硬化，肝硬化出现后，门静脉就会回流受阻，出现门静脉血流缓慢的情况，从而形成涡流，导致血小板聚集，形成门静脉血栓，引起肝硬化包括乙肝肝硬化、酒精性肝硬化，血吸虫性肝硬化；

第二、腹腔感染，比如阑尾炎、胆囊炎、胰腺炎等，感染时细菌栓子也会进入门静脉内，最终形成门静脉血栓；

第三、肿瘤系统疾病，肿瘤疾病包括肿瘤本身对于门静脉的阻塞作用，导致血流缓慢，形成门静脉血栓，同时，肿瘤性患者在门静脉局部会形成高凝状态，最终也会形成门静脉血栓。