耵聍冲洗后耳朵疼可能是正常生理现象，也可能是外耳道疖、耳膜破裂等原因引起的，需要根据不同的病因做具体分析。

1、正常生理现象：进行耵聍冲洗时，若是耵聍过于坚硬，并且与外耳道黏膜粘附过紧，冲洗时耵聍突然从外耳道皮肤上撕下，将刺激外耳道皮肤神经，冲洗过程中由于有水流作用，并未感觉明显疼痛，当耵聍冲洗后出现耳朵疼的症状。

2、外耳道疖：外耳道疖是指细菌侵入毛囊或皮脂腺所发生的化脓性炎症。细菌入侵毛囊或皮脂腺，可使毛囊内或皮脂腺化脓形成脓痂。耵聍冲洗时，若是耵聍过于坚硬，加之冲洗的水流过大时，将导致外耳道皮肤破裂，细菌入侵毛囊或皮脂腺，引起外耳道疖，出现耵聍冲洗后耳朵疼的症状。

3、化脓性中耳炎：是中耳黏膜的化脓性炎症，其主要致病菌为肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、溶血性链球菌等。耵聍冲洗时，若操作不当可引起化脓性中耳炎，出现耵聍冲洗后耳朵疼的症状，还可出现耳鸣、耳部闷胀感、听力下降等症状。