人流两周还有褐色分泌物，可能与恢复排卵、宫腔残留、感染等因素有关。

1、恢复排卵：每个女性流产后恢复排卵的时间不固定，部分女性可能在人流两周后，会有恢复排卵现象。由于排卵前雌激素水平升高，可能会刺激少量子宫内膜脱落，引起出血并氧化，形成褐色分泌物流出。

2、宫腔残留：如果女性在人流后，宫腔内的蜕膜组织不能全部排出，容易形成宫腔残留。此时宫腔残留物可持续刺激子宫内膜，使子宫内膜不能完全修复，造成点滴出血，最终形成褐色分泌物，同时患者还可能伴有不同程度的腹痛症状。

3、感染：女性在人流后，宫颈口为轻微扩张，同时机体免疫力可能会有所下降，当细菌等病原体通过阴道逆行感染宫腔，容易发生炎症反应。由于炎症的反复刺激，会造成异常子宫出血，进而氧化形成褐色分泌物，同时女性还可能存在发热和腹痛等症状。

若女性在人流后长期存在阴道褐色分泌物，或者出现其它不适症状，应及时就医。