扁桃体一侧有个洞，考虑与扁桃体隐窝、扁桃体溃疡、扁桃体癌等因素有关，不同的病因治疗方法也不同，具体如下：

1、扁桃体隐窝：是扁桃体内侧游离面覆盖鳞状上皮的黏膜，黏膜上皮向扁桃体实质内陷入，从而形成6-20个左右的隐窝，两侧都有，因此在两侧扁桃体上都会有洞，这种情况为正常结构，无需治疗。扁桃体隐窝易为细菌、病毒存留、繁殖，而形成感染病灶，因此饭后建议及时漱口，避免食物残留而导致局部发炎。

2、扁桃体溃疡：多是由于溶血性链球菌感染引起，在免疫力低下、过度劳累后容易诱发，溃疡处看起来就像有个洞，同时伴有明显的疼痛。建议在医生指导下应用抗生素治疗，比如头孢地尼、阿莫西林、左氧氟沙星等；也可以补充富含维生素的蔬菜、水果，提高机体的免疫力；同时可应用漱口水或者淡盐水漱口，保持口腔部卫生。

3、扁桃体癌：是口咽两侧壁扁桃体窝内的恶性肿瘤，若是瘤体出现凹陷性溃疡就会形成一个洞。通常对于早期局限性扁桃体癌，建议行手术切除治疗；若是伴有颈部淋巴结转移，则需要行颈部淋巴结清扫术，同时配合放、化疗，主要的化疗药物包括紫杉醇、盐酸吉西他滨、顺铂等，化疗药物应在医师指导下进行应用。