反流性食管炎可出现烧心、反酸、恶心、呕吐等症状，该病的鉴别主要是针对于出现这些症状的疾病进行鉴别。

需要与慢性胃炎、真菌性食管炎、药物性食管炎、食管癌、食管贲门失弛缓症、消化性溃疡、胆道疾病等相鉴别，这时可以进行胃镜检查明确诊断。当出现以胸痛为主要表现的时候，还需要与心源性胸痛及其他原因引起的非心源性胸痛进行鉴别。此外，还要注意与功能性消化不良相鉴别。必要时再完善胃镜、心电图等检查。