慢性扁桃体患者常常有咽痛、易感冒，还有急性扁桃体炎的发作史，可以有咽内发干、发痒、异物感，刺激性咳嗽、口臭等症状。小儿可以出现呼吸不畅，睡眠时打鼾，吞咽或者是言语共鸣的障碍。此外，还可引起全身反应。

慢性扁桃体炎多由急性扁桃体炎反复发作，或者是因扁桃体隐窝引流不畅，隐窝内的细菌、病毒滋生感染而演变为慢性炎症。患者常常有咽痛、易感冒，还有急性扁桃体炎的发作史。平时自觉症状比较少，可以有咽内发干、发痒、异物感，刺激性咳嗽等轻微的症状。如果扁桃体隐窝之内潴留干酪样腐败物，或者有大量的厌氧菌感染，则会出现口臭。

小儿扁桃体过度肥大，还可以出现呼吸不畅，睡眠时打鼾，吞咽或者是言语共鸣的障碍。由于隐窝的脓栓被咽下，刺激胃肠，或者是隐窝内细菌、毒素等被吸收，还可以引起全身反应，导致消化不良、头痛、乏力、低热等。