卵巢囊肿5cm一般不建议跑步，如果做过于剧烈的运动，可能会发生卵巢囊肿破裂、卵巢囊肿蒂扭转等危害，威胁生命健康。

1、卵巢囊肿破裂：卵巢囊肿的患者因为卵巢异常病变，更容易受到外界因素的挤压刺激，主要是因为卵巢当中存在异常增大囊肿，囊肿组织当中含有不同程度的液体，导致囊肿的外壁组织变得比较薄并且脆弱，在腹部受到挤压、进行一些剧烈活动（比如快速跑步）或者是抓举重物的时候，腹部压力都会增大，从而容易引起囊肿破裂，因此在平时更需要谨慎选择运动项目。

2、卵巢囊肿蒂扭转：卵巢囊肿5cm，具有一定的重量，跑步时由于重力的作用可能会导致囊肿出现蒂扭转，使卵巢囊肿根部的血液循环突然受阻，可能会引起急性下腹部疼痛等不适，还可能伴有恶心、呕吐等症状。需要尽快去医院就诊必要时行剖腹探查手术治疗。

对于卵巢囊肿比较大（大于或者等于5cm）的患者来说，不建议跑步。可以进行一些舒缓的运动，例如慢走和太极等。