肛周脓肿不管其脓腔破裂与否，其治疗方式都是以手术治疗为主。肛周脓肿脓腔一直不破，可能与脓腔壁较厚或者脓腔内脓液的量较少有关，其治疗通常需行切开引流或其他手术治疗方式（如切开引流+挂线疗法），术后需要定期换药及冲洗脓腔。此外，还可外用抗生素软膏如红霉素软膏、莫匹罗星软膏，口服或静滴相关敏感性抗生素如罗红霉素、氧氟沙星、头孢拉定等控制局部及全身感染。治疗期间还需调整饮食结构和生活习惯，禁忌辛辣刺激饮食，以易消化的清淡饮食为主，适当锻炼，规律作息，充足睡眠。还可行温水坐浴，缓解局部不适感。

肛周脓肿为肛周组织的感染性病变，常由肛腺阻塞、肛隐窝感染引起。脓腔体积较小且处于低位靠近皮肤侧，触之无明显波动感、紧绷感，仅有局部轻度疼痛，未见其他伴随症状及全身症状，一般病情不严重，较易处理。脓腔较大，且脓腔处于高位远离皮肤组织，触之有明显波动感、紧绷感，局部疼痛症状明显，可见其他伴随症状如肛周坠胀感、里急后重、排便、排气不畅等及全身症状如高热、寒战、头晕、头痛等，则说明病情较为严重，建议住院进行综合性治疗。