肛瘘会有一定的疼痛感，不过大部分情况下疼痛不会特别严重。因为肛瘘是一种常见的肛门部感染性疾病，是由内瘘口、窦道、外瘘口所组成，如果患者处于急性炎症感染时会疼痛，患者会出现肛门部的胀痛感。同时，在外瘘口会有肠液或者是脓液排出体外，如果炎症感染比较轻，局部的疼痛感就会比较轻。

在发现肛瘘后，需要尽早去医院的普外科或者是肛肠外科进行手术治疗。一般会进行肛瘘剔除术或者是肛瘘挂线术，后期再给予规律换药，有时还需要配合药物坐浴治疗，来促进肉芽组织的尽快生长，在发现该疾病后应避免饮酒，不要吃辛辣食物。