真菌性角膜炎的症状与其他类型的角膜炎相似，比如会出现眼睛痛、眼红、畏光、流泪、视物模糊等。

真菌性角膜炎通常进展比较缓慢，相对于细菌性角膜炎，其病变比较轻微，并且还会出现特征性的改变，比如可以在角膜表面看到菌丝的苔被，可以检查到卫星病灶和免疫环以及内皮斑，严重的还会出现前房积脓等特征性的改变。真菌性角膜炎是常见的角膜炎症中的一种，多数患者会有植物外伤史的病史，也就是被一些农作物，比如树枝、稻草、麦穗等植物把眼睛划伤，此为真菌性角膜炎感染最重要也是最常见的原因。