脊柱肿瘤的病因尚不明确，有很多可能的因素。脊柱肿瘤可以分为原发性肿瘤以及继发性肿瘤。原发肿瘤的相关因素比较多，可能与患者接触的放射线有关，比如X射线或者伽马射线；有的患者接触化学物质，比如苯或者是重金属，也容易出现脊柱的肿瘤；有些患者因为一些生物性因素，例如某些病毒的感染以及某些真菌感染，也会造成患者出现脊柱肿瘤的情况。

继发性肿瘤，如患者原有其他部位的癌症，如原有的肺癌、乳腺癌、前列腺癌，可以转移到脊柱上，形成脊柱肿瘤；一般应取病理活检明确性质，并采取对症方式进行治疗。