甲胎蛋白本身对人体没有太大的危害，引起危害的只是造成甲胎蛋白升高的疾病。甲胎蛋白主要由胎儿的肝细胞及卵黄囊合成，甲胎蛋白在胎儿的血液循环中具有较高的浓度，出生之后出现下降，出生之后的两到三个月，甲胎蛋白基本被白蛋白替代，血液当中较难检测出，所以在成人的血清当中含量极低。

目前临床上主要作为原发性肝癌的血清标志物，用于原发性肝癌的诊断及疗效的监测，甲胎蛋白升高往往提示存在肝癌。肝癌是一种恶性程度极高的恶性肿瘤，会对人体产生严重的危害，甚至危及生命。如果患者平常有肝炎的病史，发现甲胎蛋白明显升高，需要注意原发性肝癌的可能，应该尽早到医院诊断和治疗。