临床上，做腰穿的作用比较广泛，一般来说，其目的是检测一些中枢神经系统的病变，或者脑炎、脑膜炎类的感染，以及周围神经病变等多种疾病。

首先，需要确定患者是否为中枢神经系统的病变，如蛛网膜下腔出血。进行腰穿检查后，明确脑积液中是否含有大量的红细胞，可以协助诊断。此外，通过腰穿还可以检查出各种脑炎或者是脑膜炎，此类患者的脑脊液中含有特异性炎性细胞。另外，做腰穿还可以用于检查是否有周围神经病变，尤其是免疫系统介导的周围神经疾病。比如脑脊液检查的结果显示蛋白细胞分离，则是急性格林-巴利综合征的诊断依据。