自闭症的患者发生肠瘘的情况下，建议由精神科的医生和普外科的医生共同合作。而治疗此类疾病由精神科的医生调整自闭症的状态，而由外科医生给予双套管的持续冲洗，经过冲洗，再加上积极的营养对症支持治疗，肠瘘大部分可以愈合。

如果是小的瘘口经过营养支持，加双套管的持续冲洗，基本上可以愈合。如果是在半年之内没有完全的愈合，可以考虑进行手术治疗。这两个疾病集中在同一个患者，建议还是到规模较大的医院进行相应的规范诊疗，当然一定要是完善相关检查，明确诊断后，再给予规范的治疗。