碘酒的消毒原理是将细胞原浆蛋白中的活性基团氧化，再与氨基酸结合，按比例进行调配，可以达到消毒、杀菌的效果。

　　碘酒是一种固态的碘和乙醇的混合物，碘化钾可以帮助碘溶解在乙醇中，碘酒可以让细菌蛋白变性，从而达到杀菌的目的。对细菌、病毒感染均有杀灭作用。碘酒是用来治疗皮肤的炎症和消毒的。可外用，以达到对细菌的氨基酸、酶进行变性，达到消毒的作用。可以防止皮肤黏膜感染。亦可作为外科手术前的皮肤杀菌剂。另外，碘酒还具有良好的渗透作用，可以促进局部血液循环，起到消炎止痛的作用。

　　对于酒精、甲状腺功能紊乱等人群，不建议使用碘酒。阴道、鼻腔、口腔黏膜等部位都不适合进行消毒。碘酒是一种酒精物质，也不能用来消毒溃烂的皮肤，要在医生的指导下使用药物。