一般情况下，儿童乙肝打完三针还是阴性可能是免疫系统不完全、疫苗存储问题、感染乙型肝炎病毒等因素导致。具体如下：

　　1、免疫系统不完全

　　有些儿童的免疫系统可能不够强大，无法产生足够的乙肝表面抗体。

　　2、疫苗存储问题

　　如果疫苗在运输或存储过程中出现了问题，疫苗中的抗原可能会失去活性，从而影响疫苗的免疫效果。

　　3、感染乙型肝炎病毒

　　如果儿童在接种乙肝疫苗前已经感染了乙型肝炎病毒，那么乙肝疫苗就无法预防感染。此时，即使接种了乙肝疫苗，乙肝表面抗体仍然为阴性。应及时就医，可在医生指导下服用恩替卡韦颗粒、拉米夫定颗粒、阿德福韦酯颗粒等药物进行治疗。

　　此外，也可能和疫苗品种有关。如果儿童已经打了完整的三针乙肝疫苗，但仍然没有产生乙肝表面抗体，建议家长和医生一起评估疫苗接种情况并制定后续措施。可能需要重新接种乙肝疫苗或采用其他措施来保护儿童的健康。