一般来说，替硝唑和甲硝唑区别在于临床应用不同、副作用不同、药效持续时间不同。具体分析如下：

　　1、临床应用不同

　　替硝唑对各种常见的致病厌氧菌，以及滴虫的杀灭作用比甲硝唑强了2~4倍，而且甲硝唑是第一代硝基咪唑类抗菌药，替硝唑是第二代。

　　2、副作用不同

　　甲硝唑的副作用一般是恶心、呕吐、腹痛等，而替硝唑的副作用比甲硝唑少，仅有轻微的头晕、眩晕、便秘，或者是皮肤瘙痒、皮疹等症状。

　　3、药效持续时间不同

　　替硝唑的药效持续时间比甲硝唑更长，甲硝唑口服后药物有效浓度只能维持12小时左右，替硝唑口服后药物有效浓度能维持18小时左右。

　　总之，两种药物都是抗厌氧菌活性的药物，需要注意的是这两种药物均经肝脏代谢，肝功能不全的患者应在医生指导下酌情调整剂量。