生化妊娠干净后肚子隐隐痛可能是生理因素导致的，也可能是病理因素导致的，如宫颈炎、十二指肠炎等。具体分析如下：

　　一、生理因素

　　生化妊娠一般是表示精子与卵子结合后，在宫腔内未正常着床，而出现了终止妊娠的情况，可能会刺激子宫出现异常收缩现象，导致生化妊娠干净后肚子隐隐痛的症状，属于正常生理现象，随着时间的推移便会自行缓解。

　　二、病理因素

　　1、宫颈炎

　　厌氧菌、淋病奈瑟菌、肠球菌等感染，都可能引发宫颈炎，使患者宫颈管黏膜在炎症的刺激下，产生上述症状，可以遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行治疗。

　　2、十二指肠炎

　　十二指肠炎一般是幽门螺杆菌感染所导致的胃肠道炎症性疾病，患者十二指肠黏膜在病菌的侵袭下，可能会出现该症状，可以遵医嘱使用奥美拉唑肠溶胶囊、雷贝拉唑钠肠溶片等药物。

　　除此之外，生化妊娠干净后肚子隐隐痛可能是子宫内膜炎、子宫内膜息肉、阴道炎等导致的。建议患者在进行针对性治疗期间，忌食生冷性食物。