引起小儿川崎病的原因，目前尚不清楚，也较为复杂，可能与感染有关，有证明能引起川崎病免疫异常反应的超抗原，是一株特异性白色葡萄球菌的内毒素和链球菌的红斑毒素。

　　此毒素可作为一种超抗原，启动暂时性免疫异常反应，而导致川崎病免疫亢进，发生一系列的病理改变，而出现川崎病的一系列症状。