小儿川崎病目前病因不明，主要是考虑和免疫功能机制有关系。除了免疫机制已关，还有有流行病学的资料提示立克次体、葡萄球菌、链球菌反转录、病毒支原体感染可能为诱因。但是目前仍然是没有证实总体发病机制是不一样的。

　　所以现在目前为止主要跟免疫机制有关，所以发病年龄是以婴幼儿多见，80%在5岁以下，男女的发病比例为1.5:1。