核磁共振因为由成像原理决定，是以氢质子在磁场下的成像为主要的信号，所以当人体内含有大量水，部分的信号会强，在核磁的成像下非常清晰，所以对软组织的分辨非常清晰。

　　骨头非常硬里面含有水很少，所以骨性结构、钙化在磁场下的信号弱，很难进行显像。

　　另外肺脏里面因为含有大量的气体，而且肺脏呼吸运动时会出现伪影，所以肺脏是磁共振检查的盲区。

　　常用的核磁检查对全身的神经系统、脊柱、实质脏器成像非常清楚，但是核磁检查因为成像序列，检查时间会比CT长，所以年老体弱的患者可能不能耐受。