软组织分辨率可以应用人体的各个系统的正常和异常的影像学的诊断方面，比如应用于脑梗死、脑血管疾病这一类的疾病的影像诊断，也可以应用在脑肿瘤早期发现和预后的判断上。

　　其次，可以应用在腹部的疾病的检查，比如肝内肿瘤、胰腺、脾、胆囊的病变，比如胆结石、胆囊炎等显影都是非常好。

　　此外，磁共振由于软组织分辨率非常高，可以应用在人体的各个肌肉组织、骨关节方面，比如关节的软骨的显示、关节囊显示、韧带显示，这些都是CT、超声无法取代。