脑炎分为细菌性脑炎和病毒性脑炎以及真菌脑炎。大多数病毒性脑炎愈后是非常好的，多数患者能够完全康复，病程大概2~3周。

　　不良预后和病变严重程度，病毒的种类，还与儿童的年龄相关。临床病情重，全脑弥漫性病变者愈后比较差，会遗留惊厥和智力、运动、心理行为、视力和听力残疾。而化脓性脑膜炎大约1/3，会遗留不同程度的后遗症。真菌性脑炎，相对来说治疗非常困难。