脑膜炎的后遗症有很多，大概会有30%左右遗留后遗症。化脓性脑膜炎会有并发神经性耳聋、智力低下、癫痫、视力障碍以及行为异常等。

　　而病毒性脑炎，大多数可以完全康复，少数会遗留癫痫、肢体瘫痪、视力倒退等后遗症。后期主要是以康复训练为主，严密观察病情，营养脑细胞，支持治疗。