亚急性甲状腺炎是病毒感染，多是在上呼吸道感染以后，病毒波及到了甲状腺而引起甲状腺发炎。一般这个疾病会经历甲亢期、甲减期，最后到甲状腺功能正常期，一般这个疾病的甲亢期通常于1~2个月内缓解，整个病程小于一年。

　　而滤泡储碘功能的恢复是比较慢的，可以长至临床症状完全缓解后的一年以上。这个疾病有极少数的患者可能会发生永久性的甲减，因此患这种疾病的患者需要每年检查一次甲状腺功能，长期随访持续多年。