医院获得性肺炎的病原菌可以由细菌、真菌、支原体、衣原体、病毒或原虫等引起，其中细菌是最常见的致病原。

　　医院获得性肺炎常见的病原菌是革兰氏阴性杆菌，包括铜绿假单胞菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌和不动杆菌。

　　金黄色葡萄球菌感染常在糖尿病、头部创伤和ICU患者发生。