扁桃体肥大的原因常常是免疫力低下，或者是反复的上呼吸道感染，反复的扁桃体发炎治疗不彻底。

　　也有可能是反复的鼻炎、鼻窦炎，刺激咽喉部，或者是各种呼吸道的炎症，长期张口呼吸，炎性分泌物反复刺激扁桃体，或者是粉尘、辛辣事物、有害气体、过敏原的反复刺激，都有可能引起扁桃体肥大。