面肌痉挛的病因可能与面神经通路上某个部位受到病理性的刺激所造成,但是目前其确切的病因尚不清楚,也称为原发性的面肌抽搐。
大部分患者可能是由于椎基底动脉的动脉硬化性扩张或动脉瘤压迫,甚至是正常血管变异交叉呈微血管襻儿压迫面神经,有的是面神经炎后脱髓鞘变性,以及脑桥小脑角肿瘤、炎症所导致。